iPhone 3GS, iPod touch 2GのJailbreakにも対応した「PwnageTool 3.1.3」がリリースされています。
ただし、このPwnageTool 3.1.3でJailbreakできるのは、ファームウェアのバージョンが「3.0」か「3.0.1」の本体のみ。ファームウェア3.1をすでに導入済みの本体は、このツールを使ってJailbreakは行えません。そのため、ファームウェア3.1がプリインストールされているiPod touch 3Gについても非サポートとなっています。
手順はiPhone 3.1に対応したPwnageTool 3.1でJailbreakを参考にしてください。